More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4078 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 316 aa  604  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2382  regulatory protein PupR, putative  41.72 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  34.54 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  25.39 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.3 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  29.18 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.09 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  27.68 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.23 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.47 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 320 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.84 
 
 		 368 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  34.01 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.15 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  34.33 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.57 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  29.77 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  26.4 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.71 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  30 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.48 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.35 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.23 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  24.92 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  27.55 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.86 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.27 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  30.53 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  30.73 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.51 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  26.65 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.11 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.09 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  28.75 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  29.87 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  26.8 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  29.18 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.62 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  33.77 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  32.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.53 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  27.05 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.74 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  29.13 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  34.31 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  35.98 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.43 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  30.35 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  28.71 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  30.56 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  27.85 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  28.62 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.51 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  30.15 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  34.45 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  30.41 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.44 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  27.06 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  30.19 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.07 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  33 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.09 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  28.62 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.78 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.88 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  29.18 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.41 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  30 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.19 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.8 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.11 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.09 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  26.25 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  27.18 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  28.93 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  32.02 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>