More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3721 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 342 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  42.11 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  29.59 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.73 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.12 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  32.19 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.86 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.51 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.34 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.65 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.74 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  26.14 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.57 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  33.65 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  34.02 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  36.65 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.15 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  33.44 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.74 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.93 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  34.26 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.33 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  31.83 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  26.44 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  34.86 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.68 
 
 		 264 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  31.71 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.55 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.42 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.24 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.9 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  34.95 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  33.48 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.65 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.45 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  34.58 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.39 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.85 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.5 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.77 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  35.2 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.82 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.7 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.93 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.1 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  31.21 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.39 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  30.58 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.19 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  28.22 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  27.88 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.43 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  31.15 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 444 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.8 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.63 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 		 440 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  33 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.25 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 375 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.47 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  30.74 
 
 		 324 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.25 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  32.15 
 
 		 326 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  34.57 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  29.88 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  34.72 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  32.25 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  24.62 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.99 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.95 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.75 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  31.44 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  28.62 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  27.49 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>