More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2882 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  100 
 
 		 334 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  49.53 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  49.37 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  45 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  42.03 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  35.99 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  34.86 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  35.87 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  35.06 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  33.75 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  34.06 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  35.12 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  33.75 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  35.11 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.64 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  32.03 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.96 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  34.24 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.46 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.02 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.29 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.32 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.94 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.1 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.58 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  34.29 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.55 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.65 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  31.6 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  30.84 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  32.81 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.68 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.74 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.31 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  28.38 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.88 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.88 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  31.1 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.29 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  26.9 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.24 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.58 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  28.57 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.6 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.91 
 
 		 374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.91 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  31.27 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  37.14 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  29.21 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  28.8 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  34.15 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  35.55 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  32.25 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  29.41 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  29.74 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  30.19 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  29.67 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  30.97 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  26.87 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.45 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  28.09 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  27.3 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  27.62 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.76 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  27.5 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  33.71 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  30.28 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  29.73 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.45 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  27.19 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  27.52 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  29.54 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>