More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3044 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  100 
 
 		 318 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  52.32 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  37.06 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  34.65 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  35.37 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  35.43 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.46 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  34.43 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.11 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  34 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  34.08 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.7 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.45 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.76 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.55 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.75 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.01 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.91 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.12 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.73 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.1 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.82 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  32.87 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.8 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.38 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.3 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  30.1 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  31.41 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  35.25 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  28.94 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.63 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.75 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  33.65 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  29.97 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.67 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  30.27 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  30.19 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.77 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.66 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  33.23 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  32.33 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  29.97 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  30.49 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  34.06 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  36.67 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.33 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  37.04 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.05 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.92 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.53 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.6 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  30.06 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.48 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  28.88 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  30.15 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.88 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.71 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  29.97 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  27.41 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.76 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.27 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.8 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.26 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  31.84 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  26.95 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  26.69 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.13 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  27.9 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  29.81 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  27.88 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.14 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  26.78 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  26.71 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  29.93 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>