294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2206 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  100 
 
 		 328 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  38.6 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  40.68 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  39.63 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  41.19 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  40.61 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  38.05 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  37.2 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  39.24 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  38.72 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  37.69 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  34.98 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  35.47 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  35.1 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.77 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.38 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.12 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.3 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.51 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.7 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.03 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  29.56 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  31.35 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  29.47 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.91 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.57 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  27.81 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  30.53 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.66 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  28.35 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.94 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.04 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.64 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  23.08 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  28.97 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.78 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.1 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.21 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  26.73 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.8 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  28.85 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  28.86 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.43 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  26.52 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  27.8 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.99 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  27.62 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.24 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.24 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  24.56 
 
 		 351 aa  85.9  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  25.55 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  27.35 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  32.12 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  28.38 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  30.17 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  25.87 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  31.61 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.95 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  26.9 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  25.75 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  28.64 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  25.17 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  23.96 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  28.71 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  26.81 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  27.18 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  24.85 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  30.66 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  31.63 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.52 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  27.88 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  27.69 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  27.3 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  29.56 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  24.75 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  29.58 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  25.24 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>