More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2388 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  34.77 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.15 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.81 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.82 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  36.45 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.54 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  34.35 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  33.08 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.78 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  31.13 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.26 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.42 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.62 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  31.35 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.32 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.05 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.02 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  31.33 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  28.79 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.84 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  31.19 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.31 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.33 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  24.63 
 
 		 350 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  30.83 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  35.38 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  32.58 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  32.25 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.33 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  29.32 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.13 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.06 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.93 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  27.31 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  24.64 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.04 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.95 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  34.27 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  37.34 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  28.02 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  28.73 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.08 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  34.62 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  29.82 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  38.36 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.68 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.2 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.39 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  30.83 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.74 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  24.6 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  34.52 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.31 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  33.33 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  33.91 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  36.6 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  37.75 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  33.33 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  34.71 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.59 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  26.5 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  29.41 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  25.12 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  35.03 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  29.17 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.96 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  32.69 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  36.3 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  31.84 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>