More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1968 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 336 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  36.83 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  33.63 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  34.49 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31.86 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  33.03 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  34.14 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  35.62 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.79 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.91 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.85 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.49 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  43.81 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  26.76 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  26.04 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  36 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  36.5 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  37.81 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  31.64 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  34.11 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  38.42 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.48 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  32.24 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.03 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  25.38 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.43 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.65 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.51 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.73 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  26.45 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.23 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.44 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  36.22 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.13 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  35.75 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  33.54 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.5 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  30.57 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  31.17 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.07 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  32.81 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.05 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.69 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  31.71 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.07 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  33.68 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  32.6 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.46 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.22 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.03 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.58 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  35.26 
 
 		 378 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  37.5 
 
 		 331 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  39.04 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.82 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.39 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.89 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.09 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.35 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.85 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.73 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.22 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.48 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  34.65 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  25.94 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.36 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  31.44 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  28 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  25.55 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  28.85 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  34.21 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  28.82 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  26.51 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.5 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>