More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0733 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  98.17 
 
 		 328 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 328 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  90.65 
 
 		 310 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  69.68 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.53 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.57 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.76 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  27.12 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.38 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  28.92 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  29.43 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.1 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.99 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.56 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.12 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.93 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.89 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  30.98 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.39 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  26.37 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  28.75 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  29.24 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  32.53 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.1 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.33 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.27 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.34 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  28.03 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  25.54 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.19 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.87 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  29.91 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  32.23 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.23 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  27.8 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  30.94 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.53 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  26.54 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.31 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  29.28 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  32.2 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  27.41 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  30.84 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.26 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.73 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  28.92 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  28.39 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.8 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.98 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  27.61 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.1 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  29.34 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  27.42 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  26.93 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  31.85 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  28.97 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.69 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.62 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  29.31 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  27.47 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  29.3 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  30.77 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.6 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  27.64 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  24.1 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  27.49 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  25.78 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.66 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  26.77 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  25.33 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  26.51 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  26.61 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>