More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1491 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 340 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.11 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.33 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.43 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.52 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  30.25 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.1 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.14 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  31.28 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  23.6 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.57 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  28.26 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  27.74 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  26.87 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.65 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.07 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  28.78 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  30.29 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.45 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  32.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.42 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.06 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  30.07 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  31.95 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  30.03 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  29.81 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.85 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  25.85 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  26.77 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  31.43 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  25.99 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.02 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.88 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  27.03 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  25.6 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.92 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  24.02 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  31.22 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  26.04 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  29.25 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  27.63 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  29.84 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  27.05 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  25.23 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  32.28 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.92 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  25.74 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  23.03 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  28.93 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.11 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  27.99 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  28.82 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  28.86 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  26.8 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  25.75 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  28.3 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  26.83 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  22.92 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  26.9 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  28.66 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  33.83 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  31.06 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  38.32 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.26 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.96 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0254  FecR protein  25.08 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  26.69 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  27.63 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>