More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1133 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 322 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  34.71 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  33.01 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  33.44 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  29.5 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.41 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  30.93 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.46 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  25.57 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  34.12 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  32.33 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  32.89 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.45 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  38.5 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.8 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.61 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.39 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.16 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.43 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  24.65 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  32.56 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  27.63 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  32.37 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  28.72 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.77 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  31.41 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  31.28 
 
 		 274 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  30.22 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  33.66 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  29.14 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  32.09 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.93 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.19 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  27.85 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  28.67 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.29 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.3 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.92 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.24 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  30.3 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.79 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  30.14 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.89 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  32.48 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  28.83 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.55 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  30.51 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.12 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.86 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.43 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  23.55 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  22.92 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  26.9 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.17 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.71 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  28.72 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  27.64 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.2 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  27.45 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.1 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  29.47 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  27.67 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  27.24 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  30.46 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2382  regulatory protein PupR, putative  29.93 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.97 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  27.21 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  28.67 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.06 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>