226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5188 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  100 
 
 		 315 aa  608  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2530  putative FecR  30.28 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.9 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.66 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  24.63 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  26.22 
 
 		 359 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.15 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  26.77 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  26.75 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  30.7 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  28.08 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  29.56 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  26.92 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  22.88 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  27.13 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.38 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.94 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.66 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  30.03 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  26.25 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  23.65 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  28.94 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  32.04 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  32.04 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.08 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  26.46 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2599  putative FecR  30.77 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  28.53 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  27.56 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  28.88 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  21.7 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  27.96 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  26.15 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  28.05 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  25.76 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  25.47 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.77 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.18 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  25.99 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  29.08 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  24.02 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.44 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  26.4 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.8 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.57 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  28 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  26.58 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.84 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  28.46 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  27.92 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  22.99 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  28.98 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  23.99 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.4 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  27.91 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.59 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.39 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  30.74 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  30.22 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  24.76 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  29.65 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  25.23 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  29.5 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  28.52 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  21.97 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  29.66 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  28.62 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  27.66 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  30.03 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.03 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.23 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  27.07 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  23.22 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  29.54 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  26.27 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  25.54 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  28.94 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.76 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  27.48 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.54 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>