257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2599 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2599  putative FecR  100 
 
 		 365 aa  734    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2530  putative FecR  35.54 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  31.13 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.07 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  31.02 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.1 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.6 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.63 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  25.14 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  30.73 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.4 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.43 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  27.99 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  26.74 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.86 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  28.29 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  25.43 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  30.73 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  32.58 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  25.07 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.36 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.49 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  28.96 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  29.68 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  27.09 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  30.65 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  25.46 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.17 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  26.45 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  24.08 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  25.61 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  28.1 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.57 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.57 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  28.29 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.2 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  27.88 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  28.51 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  27.64 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  26.5 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  25.79 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  25.71 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  29.06 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  28.51 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  27.4 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  27.2 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  26.87 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  26.51 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  26.85 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  26.47 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  24.73 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  29.19 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  29.19 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  28.1 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  29.19 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.62 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.44 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  29.19 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.15 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  27.93 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  28.5 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  25.93 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  23.68 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  28.71 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  25.95 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.26 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  24.71 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.59 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  26.52 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  26.13 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  25 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.81 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  24.26 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  27.06 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  25.96 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  27.09 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  26.33 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  25.75 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  28.26 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>