More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2882 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 378 aa  778    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  43.9 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  41.22 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  43.3 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  40.57 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  41.62 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  43.99 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  41.24 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  40.37 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  43.68 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  41.33 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  41.15 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  41.47 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  40.51 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  47.67 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  41.53 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  44.71 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  38.8 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  38.78 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  39.9 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  37.11 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  39.26 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  40.29 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  40.21 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  41.34 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  47.92 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  45.9 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  38.83 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  40.91 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  39.58 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  44.3 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  38.11 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  39.55 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  36.83 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  35.66 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  39.42 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  34.12 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  39.04 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  37.63 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  44.19 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  35.2 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  33.75 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  45.13 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  38.17 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  37.27 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  36.5 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  44.77 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  41.7 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  40.94 
 
 		 397 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  35.19 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  37.85 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  43.06 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  36.24 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  36.24 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  38.71 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  39.04 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  45.62 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  37.91 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  31.27 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  33.97 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  34.81 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  31.2 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  32.88 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  32.94 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  28.45 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  35.96 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  36.23 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  30.31 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  33.94 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.94 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.55 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.68 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  26.35 
 
 		 361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  30.4 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  34.27 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.49 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  31.43 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  29.06 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  32.93 
 
 		 308 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  30.9 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  31.49 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  34.1 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  35.26 
 
 		 336 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 365 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.53 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  29.38 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>