More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6567 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 365 aa  750    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  34.44 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  35.45 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  35.66 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.23 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  32.34 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  30.67 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  32.05 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  31.65 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  30.75 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  32.48 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  31.47 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  31.47 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.33 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  32.2 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  29.79 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.17 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  30.83 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  28.45 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  30.04 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  29.84 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  28.19 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  29.41 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  30.47 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.19 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  32.47 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  29.04 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  31.6 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.51 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  29.66 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  29.31 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  32.4 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  28.63 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  28.74 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  32.52 
 
 		 333 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  28.74 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  30.8 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  27.97 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  27.92 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  28.02 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  26.87 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  26.84 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  25.5 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  28.82 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  27.9 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  31.2 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  27.34 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  27.1 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  31.5 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  27.07 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  28.75 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  29.53 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  24.52 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  37.09 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  26.38 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  31.22 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  28.04 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  28.03 
 
 		 381 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  28.57 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  26.07 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  29.71 
 
 		 385 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.57 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  25.63 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.57 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.96 
 
 		 411 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  29.2 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  28.69 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  27.82 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  30.71 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.88 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  29.13 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>