More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1889 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 334 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  27.32 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  27.89 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  25.52 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  25.21 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.27 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  28.28 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  25.26 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  25.13 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  28.97 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  27.05 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.76 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  25.65 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  28.18 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  28.98 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  28.48 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  30.99 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  25.96 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  24.94 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  26.22 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.31 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 405 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  25.7 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  24.03 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  35.24 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  25.38 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  35.23 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  25.92 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  25.58 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  24.35 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  35.18 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  26.92 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 386 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  26.82 
 
 		 378 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 383 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  25.4 
 
 		 397 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  26.76 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  32.55 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  25.95 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  26.49 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  24.23 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  27.47 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  30.92 
 
 		 381 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  24.21 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  27.15 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  25.34 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  32.31 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  23.24 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  23.96 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  26.28 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  31.55 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  25.63 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  27.93 
 
 		 387 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  26.14 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  23.43 
 
 		 348 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  25.6 
 
 		 379 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  23.64 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  24.93 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  24.08 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  28.1 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  27.5 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.27 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  30.39 
 
 		 396 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  24.5 
 
 		 390 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  30.1 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  25.51 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  35.37 
 
 		 378 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4372  anti-FecI sigma factor, FecR  26.88 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000128934  normal  0.0200354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  32.27 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  24.8 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  24.55 
 
 		 398 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  27.1 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  28.18 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  25.88 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 282 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  26.64 
 
 		 376 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>