247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1496 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 348 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  42.27 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  35.84 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  31.81 
 
 		 345 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 351 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  32.98 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  34.7 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  37.95 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  38.71 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  33.1 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  29.79 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  32.03 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  32.58 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  35.48 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  26.97 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.18 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  29.95 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  26.19 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.81 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  26.14 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.56 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  28.28 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  25.66 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  29.27 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  25.31 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  23.82 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6661  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  26.78 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  26.46 
 
 		 315 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25.6 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  23.62 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  26.3 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  28.67 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.96 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  25.65 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  27.43 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  27.5 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  25.24 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.54 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  23.79 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7228  anti-FecI sigma factor, FecR  28.25 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  29.82 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  25.38 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  25 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  25.59 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  23.15 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  24.31 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  33.33 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  31.21 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4372  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000128934  normal  0.0200354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  33.11 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  26.21 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  29.38 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  26.69 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  39.25 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  31.65 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  25.71 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  36.7 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  43.02 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>