More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1658 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
345 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  38.42 
 
 
345 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  35.49 
 
 
348 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 
351 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  34.59 
 
 
342 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  33.43 
 
 
350 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  31.81 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  36.08 
 
 
372 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  37.41 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  35.79 
 
 
374 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  32.94 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  37.21 
 
 
368 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 
365 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  34.57 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  33.82 
 
 
368 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  35.42 
 
 
360 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  38.86 
 
 
365 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 
341 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 
379 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 
354 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 
365 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 
381 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  34.05 
 
 
362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 
357 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  33.22 
 
 
365 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  34.05 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  34.2 
 
 
360 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 
328 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  32.07 
 
 
360 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  32.03 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  31.29 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  30.45 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  30.8 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  28.74 
 
 
321 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  27.89 
 
 
329 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  26.4 
 
 
316 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.93 
 
 
323 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  28.41 
 
 
329 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  26.27 
 
 
351 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  28.82 
 
 
313 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  29.52 
 
 
349 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  26.91 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  27.4 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  28.36 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  37.28 
 
 
307 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  23.93 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6661  anti-FecI sigma factor, FecR  32.43 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  26.39 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  29.63 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  27.15 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.93 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.46 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  26.55 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  23.94 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  25.45 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  24.16 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  25.82 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 
411 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.19 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  23.79 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  24.09 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  23.2 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  25.96 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  28.24 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  22.44 
 
 
383 aa  82.4  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7228  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  29.76 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  24.44 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  30.88 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  23.1 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  28.37 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  24.04 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  28.51 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.32 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  25.24 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  26.17 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  26.78 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  28.76 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  29.27 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  29.13 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  25.98 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  29.36 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  23.03 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  24.61 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>