More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1588 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 337 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 365 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  29.46 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  38.24 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  34.13 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  33.05 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  33.82 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  36.19 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  34.27 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  26.7 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  29.17 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  32.02 
 
 		 383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  33.48 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 378 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  28.76 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  30 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  32.49 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  25.62 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  30.4 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  37.35 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  30.77 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  25.45 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  35.5 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  35.8 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  29.23 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  34.29 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  31.71 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  25.98 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 368 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  31.44 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  27.44 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  34.7 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  27.76 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  28.77 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  30.23 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  27.35 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  29.13 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  27.09 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  29.1 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 383 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  33.14 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  29.44 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  28.04 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  32.83 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  30.74 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  28.73 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  24.72 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  29.81 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  29.19 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  35.98 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  29.44 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  24.68 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  29 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  32.96 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>