288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1242 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  100 
 
 		 371 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  34.22 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  31.89 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  28.5 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  29.19 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  28.87 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  31.69 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  29.57 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  33.64 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  37.91 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  34.96 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  33.54 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  33.44 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  30.51 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 389 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  32.69 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  32.91 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  33.59 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  33.55 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  28.64 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  35.55 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  32.59 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  36.36 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  33.96 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  34.4 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  28.13 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  27.23 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  26.97 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  28.87 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  33.96 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  32.47 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  33.58 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  27.38 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  29.57 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  31.75 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  35.35 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  28.39 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  31.67 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  34.82 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  33.77 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  34.32 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  26.71 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  30.43 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  26.98 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  29.09 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  32.96 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  32.16 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  32.56 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  28.47 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  36.9 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  24.87 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.31 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  27.63 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  30.12 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  31.08 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  29.81 
 
 		 332 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  29.68 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  26.46 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.31 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  26.27 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  28.51 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 313 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  30.1 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.96 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  22.47 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  39.81 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  21.14 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>