256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6566 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 362 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  40.54 
 
 		 374 aa  292  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  41.48 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  36.61 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  36.19 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  36.93 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  37.93 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  40.6 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  34.17 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  36.02 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.51 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  34.25 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  33.68 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  36.09 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  33.15 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  33.72 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  35.49 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  30.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  38.94 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  35.52 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  31.82 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  29.89 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  28.41 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  28.47 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  28.06 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  36.27 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  27.54 
 
 		 329 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  24.71 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.04 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  30.52 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  24.25 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  28.13 
 
 		 340 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  28.77 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  26.48 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  32.56 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.87 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  25.83 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  25.68 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  25.12 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  26.39 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25.34 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  33.91 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  24.9 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  25.12 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  26.45 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  27.01 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  32.54 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.75 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  25.66 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0442  anti-FecI sigma factor, FecR  28.4 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0522826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  25.63 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.06 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  29.15 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  31.71 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  25.6 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  25.53 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  27.01 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  27.78 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  33.54 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  29.76 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>