More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1214 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
392 aa  798    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  44.59 
 
 
383 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  37.03 
 
 
367 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  30.11 
 
 
408 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  29.5 
 
 
382 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  29.22 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  29.6 
 
 
394 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 
394 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  28.68 
 
 
383 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  28.93 
 
 
398 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  28.71 
 
 
389 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  33.46 
 
 
378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  32.87 
 
 
379 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  29.25 
 
 
372 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  28.29 
 
 
383 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  31.69 
 
 
397 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  29.52 
 
 
394 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  28.81 
 
 
361 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  27.4 
 
 
383 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  26.93 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  31 
 
 
388 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  25.37 
 
 
398 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  32.48 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  37.81 
 
 
308 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  29.47 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  27.85 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  33.48 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  28.25 
 
 
405 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  28.57 
 
 
383 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  24.87 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  29.21 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30.11 
 
 
383 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  28.17 
 
 
375 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  31.18 
 
 
384 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  28.37 
 
 
377 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 
380 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  27.42 
 
 
398 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  28.61 
 
 
381 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 
413 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  26.18 
 
 
430 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  33.78 
 
 
384 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  29.28 
 
 
385 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  29.37 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 
389 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  27.75 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  26.55 
 
 
378 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  30.99 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  27.68 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  28.73 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.47 
 
 
273 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  31.95 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  30.74 
 
 
379 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 
377 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  26.95 
 
 
408 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 
334 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 
390 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 
335 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  32.37 
 
 
407 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  30.81 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 
391 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  24.42 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  32.09 
 
 
402 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  26.07 
 
 
371 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  27.61 
 
 
390 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  25.47 
 
 
390 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  30.7 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 
337 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  27.68 
 
 
375 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  26.17 
 
 
378 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 
365 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  30.74 
 
 
371 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 
355 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 
374 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  28.39 
 
 
344 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 
321 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  26.52 
 
 
385 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  27.75 
 
 
424 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 
380 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  33 
 
 
344 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  26.84 
 
 
412 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  35.61 
 
 
332 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  31.5 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  22.65 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  29.23 
 
 
328 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>