250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3705 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 350 aa  725    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  44.38 
 
 		 348 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  34.92 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  33.43 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  33.05 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  35.93 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  33.09 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  38.84 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  35.13 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  29.48 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  32.7 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  32.2 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  33.7 
 
 		 354 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  38.07 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.17 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  29.53 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  28.46 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  27.62 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  28.06 
 
 		 335 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  24.79 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  27.9 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  24.23 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  29.46 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  26.55 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  26.52 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  24.48 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.39 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 		 282 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  25.81 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  24.86 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.28 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  25.35 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.82 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  21.75 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  22.69 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  23.25 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.45 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  26.87 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  26.8 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.04 
 
 		 367 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  22.08 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  22.94 
 
 		 383 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  29.63 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  26.06 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  26.64 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  24.36 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  24.31 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  23.87 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  30.28 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  23.1 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  23.49 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  23.62 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  26.03 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.85 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  26.25 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  24.3 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  26.23 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  21.23 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  24.88 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  24.89 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  25.71 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  27.06 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  25.27 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  29.58 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  22.17 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  24.06 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6661  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  25.89 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  25.35 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  25.69 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  26.96 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  22.89 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  27.18 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  23.67 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>