More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2830 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 345 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  39.09 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  35.38 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  32.22 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  27.49 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  27.99 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.05 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  30.14 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  30.8 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  31.84 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  31.25 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  32.93 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  30.97 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  33.2 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  27.91 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  30.31 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  34.6 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.93 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  35.32 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  32.98 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  29.56 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  34.97 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  29.48 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  38.82 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  38.26 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  32.43 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  36.26 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  37.75 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  34.9 
 
 		 389 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  32.98 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  34.67 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 397 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  31.84 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  29.82 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 381 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  25.96 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 278 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  32.56 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  34.21 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  30.58 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  32.1 
 
 		 408 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  25.58 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  34.81 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  32.56 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2767  anti-FecI sigma factor, FecR  26.46 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  29.27 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 405 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 368 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  43.56 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  30.38 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  27.67 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  34 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  29.95 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  28.37 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  28.42 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  43.27 
 
 		 412 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  25.89 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 394 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  27.56 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  43.59 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  35.29 
 
 		 375 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 280 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  36.97 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  34.54 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  31.68 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>