More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2767 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2767  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  25.99 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  26.71 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.07 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  26.37 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0254  FecR protein  26.84 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  26.64 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  29.92 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  26.5 
 
 		 347 aa  89  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  25.42 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  33.18 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  28.62 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  24.64 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  26.29 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.16 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  27.65 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  27.23 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  25.53 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  22.9 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.11 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  24.16 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  29.13 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  27.96 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  26.71 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.09 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  25.99 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  27.57 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.12 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  23.31 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  26.11 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.45 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.78 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  25.28 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  27.37 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  26.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  27.53 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  24.72 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  35.51 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  33.12 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  28.11 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  23.76 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  31.48 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  23.96 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  25.41 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.57 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  29.67 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  26.38 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  39.18 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  23.89 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  30.72 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  26.64 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.71 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  25.61 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  30.59 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  26.98 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  38.89 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  25.69 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  32.03 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  29.07 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  39.78 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.87 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  29.49 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  27.4 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  31.08 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  24.21 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  25.67 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  31.01 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  25.08 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2317  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  24.81 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  27.34 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  35.58 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  29.57 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  29.57 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  23.66 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  36 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>