More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5329 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 322 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  36.5 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  41.56 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  39.44 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  35.66 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  35 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  34.47 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  35.8 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  30.08 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  33.77 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0059  FecR protein  34.26 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  31.1 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.19 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  31.49 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  25.84 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  27.96 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.74 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  30.85 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  23.9 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  32.67 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  32.68 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  34.32 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.96 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.51 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.65 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  32.32 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.32 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  24.55 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  26.41 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0254  FecR protein  29.34 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.42 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  33.72 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  26.43 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0442  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0522826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  36.62 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.55 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  30.07 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.56 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.8 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  35.29 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  33.68 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  32.42 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  32.24 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  30.62 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.8 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  29.11 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  33.96 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  32.16 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  32 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  34.63 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  28.75 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  29.76 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  38.71 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  33.33 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.52 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  30.92 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2767  anti-FecI sigma factor, FecR  32.95 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  27.44 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  35.71 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  28.74 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.3 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.97 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  31.98 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  33.52 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.35 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  29.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  34.59 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  34.91 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  26.83 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  29.17 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.39 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  25.07 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  27.12 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>