More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3990 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  100 
 
 		 367 aa  744    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  48.52 
 
 		 408 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  47.01 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  42.96 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  43.58 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  46.01 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  44.94 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  41.22 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  43.72 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  41.37 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  43.98 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  47.9 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  42.13 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  43.94 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  40.5 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  41.56 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  44.02 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  40.37 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  40.52 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  46.53 
 
 		 402 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  41.73 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  39.14 
 
 		 424 aa  245  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  38.76 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  41.09 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  45.32 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  48.19 
 
 		 385 aa  232  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  40 
 
 		 383 aa  232  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  39.18 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  38.34 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  39.88 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  37.53 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  45.88 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  37.76 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  37.69 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  35.39 
 
 		 408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  37.91 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  41.67 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  34.62 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  42.25 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  36.83 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  37.37 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  39.75 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  42.7 
 
 		 273 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  38.34 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  37.73 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  40.37 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  40.14 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  39.35 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  35.14 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  40.21 
 
 		 398 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  37.62 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  32.55 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  40.07 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  36.27 
 
 		 397 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  41.67 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.87 
 
 		 394 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  32.9 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  33.67 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.79 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  34.51 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  33.73 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  33.22 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  32.79 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  34.52 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  31.3 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.95 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  36.63 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  34.95 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  29.14 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.11 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  29.09 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  35.48 
 
 		 316 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  27.09 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  33.53 
 
 		 323 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.6 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  28.1 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  30.39 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  28.21 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  26.89 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  29.53 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>