291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2531 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  100 
 
 
390 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  42.96 
 
 
367 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  40 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  37.99 
 
 
408 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  39.23 
 
 
354 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  39.22 
 
 
384 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  38.15 
 
 
383 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  42.65 
 
 
396 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  39.46 
 
 
387 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  38.83 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  38.99 
 
 
383 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  36.83 
 
 
378 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  37.41 
 
 
394 aa  242  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  37.28 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  37.47 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  37.91 
 
 
378 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  36.34 
 
 
389 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  38.42 
 
 
375 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  35.87 
 
 
389 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  36.03 
 
 
391 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  37.44 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  37.66 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  36.54 
 
 
402 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  39.61 
 
 
377 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  36.34 
 
 
372 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  38.56 
 
 
376 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  37.16 
 
 
375 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  37.37 
 
 
382 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  35.57 
 
 
383 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  38.78 
 
 
408 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  37.63 
 
 
373 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  34.09 
 
 
383 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  41.61 
 
 
385 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  34.93 
 
 
394 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  35.78 
 
 
398 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  35.28 
 
 
378 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  33.18 
 
 
430 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  35.03 
 
 
398 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  35.43 
 
 
424 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 
397 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  36.13 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  33.83 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  34.51 
 
 
386 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 
391 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  36.81 
 
 
392 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 
389 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 
396 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  35.48 
 
 
397 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 
405 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  37.08 
 
 
408 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  40.86 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  37.98 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  37.58 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 
413 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 
385 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  34.17 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  39.65 
 
 
398 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  31.77 
 
 
377 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  32.71 
 
 
390 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 
382 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.41 
 
 
394 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  31.76 
 
 
379 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 
386 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 
385 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 
383 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  28.39 
 
 
371 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  35.62 
 
 
374 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 
382 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  27.68 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  32.39 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  26.82 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  26.63 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  28.65 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  27.61 
 
 
392 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 
384 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  35.43 
 
 
313 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  32.07 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.93 
 
 
315 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  31.6 
 
 
278 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.33 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 
335 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  26.07 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  32.56 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  32.52 
 
 
332 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  30.88 
 
 
345 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  30 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  30.85 
 
 
282 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  29.78 
 
 
334 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  30.65 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  30.05 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>