More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3790 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  100 
 
 
392 aa  794    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  49.7 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  45.14 
 
 
380 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  47.27 
 
 
389 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  42.61 
 
 
398 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  44.71 
 
 
371 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  45.31 
 
 
372 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  51.3 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  43.51 
 
 
378 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  38.81 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  42.39 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  43.02 
 
 
376 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  48.9 
 
 
388 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  40.87 
 
 
385 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  38.19 
 
 
394 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  45.07 
 
 
383 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  44.23 
 
 
391 aa  255  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  47.43 
 
 
378 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  42.54 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  40.99 
 
 
408 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  36.43 
 
 
377 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  42.39 
 
 
378 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  45.14 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  45.77 
 
 
396 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  40.28 
 
 
387 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  39.43 
 
 
384 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  45.79 
 
 
354 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  41.25 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  42.02 
 
 
389 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  42.46 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  44.04 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  40.82 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  34 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  39.3 
 
 
386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  35.25 
 
 
398 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  41.42 
 
 
386 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  40.98 
 
 
378 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  41.36 
 
 
391 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  32.12 
 
 
390 aa  205  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  34.39 
 
 
390 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  40.23 
 
 
405 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  41.57 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  41.27 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  41.64 
 
 
398 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  36.86 
 
 
383 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  37.19 
 
 
390 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 
381 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  33.83 
 
 
397 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  36.42 
 
 
430 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  38.51 
 
 
397 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  38.12 
 
 
394 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  47.64 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  37.22 
 
 
389 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  37.36 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  35.94 
 
 
377 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  41.2 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 
396 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  34.62 
 
 
408 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  32.94 
 
 
424 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  34.23 
 
 
386 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  37.11 
 
 
379 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  31.85 
 
 
412 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 
383 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  36.41 
 
 
384 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  30.83 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  30.61 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  31.71 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 
374 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 
381 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  28.78 
 
 
351 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.32 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  27.9 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  31.17 
 
 
379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 
376 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  32.13 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.09 
 
 
317 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 
380 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 
411 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 
407 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  34.76 
 
 
330 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  34.36 
 
 
361 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 
335 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.07 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  31.98 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  31.93 
 
 
315 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  28.5 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  27.06 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  37.68 
 
 
282 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  37.25 
 
 
316 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  28.3 
 
 
329 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  28.5 
 
 
344 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  30.14 
 
 
333 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>