292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1745 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 329 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  30.61 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  31.83 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  36.12 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  29.78 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  30.9 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  28.35 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  27.15 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.11 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  28.28 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  25.87 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  26.82 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  28.42 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  28.03 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  37.26 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  28.25 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  29.36 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 365 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.68 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.02 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  33.18 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  29.07 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  32.07 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 282 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  28.06 
 
 		 379 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  30.04 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.04 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25.18 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 372 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  27.35 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  27.49 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  24.39 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  29.65 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  25.23 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  28.04 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  26.86 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  27.54 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2767  anti-FecI sigma factor, FecR  47.78 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  25.71 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4372  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000128934  normal  0.0200354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  41.88 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  26.29 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  26.99 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  26.76 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  27.32 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  31.44 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.52 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  26.87 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  26.84 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  23.82 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  26.47 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  25.25 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  25.75 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6661  anti-FecI sigma factor, FecR  27.38 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.78 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  22.55 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  30.93 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  30.66 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0658  anti-FecI sigma factor, FecR  32.54 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  25.44 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  24.34 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  27.17 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.22 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  28.5 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.4 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2317  anti-FecI sigma factor, FecR  28.16 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  26.76 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  25.36 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  33.51 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.67 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  26.09 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  30.11 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  30.54 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  28.11 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  32.95 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>