More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1219 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 333 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  43.03 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  40 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  40.55 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  41.08 
 
 		 344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  40.8 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  35 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  36.44 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  32.93 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.63 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.92 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  28.34 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  37.78 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0059  FecR protein  29.44 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.19 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  26.45 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.25 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  28.76 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.8 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.8 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  32.97 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  31.82 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.43 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.13 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.77 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  34.88 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  25.78 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  26.95 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0254  FecR protein  24.31 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.63 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.52 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  35.75 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  26.19 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.16 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  22.92 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  29.72 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2317  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  31.96 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.3 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  29.32 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  31.87 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  32.8 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  24.77 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  28.09 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  24.38 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  27.47 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  24.48 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.23 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.69 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  26.97 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  33.15 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  32.6 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  29.09 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  29.85 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  24.28 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  26.42 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  30.11 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  25.16 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  29.81 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  27.97 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  34.64 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  31.95 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  28.09 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  33.15 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  31.15 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  31.63 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  23.99 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.09 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>