More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3632 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 321 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  30.98 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.86 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  31.3 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  29.56 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  27.81 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  26.56 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  28.62 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  30.17 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  32.09 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  30.36 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  28.27 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.85 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  25.88 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  27.38 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  26.21 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  30.05 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4372  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000128934  normal  0.0200354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  34.24 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 392 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  27.7 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  28.31 
 
 		 398 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  28.02 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  28.5 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  31.32 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  26.96 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  26.33 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  27.51 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  25.29 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  28.15 
 
 		 408 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  22.47 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  28.85 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  28.38 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  24.78 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  26.06 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.74 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  31.51 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 405 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  27.11 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  29.33 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  25.99 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  27.75 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  28.46 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  26.89 
 
 		 278 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  27.73 
 
 		 371 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  26.61 
 
 		 389 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  31.53 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  27.71 
 
 		 385 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  29.44 
 
 		 371 aa  92.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  26.4 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  26.07 
 
 		 383 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  28.74 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  26.22 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  26.46 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  24.46 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  26.39 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  26.82 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  27.95 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  29.11 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  25.12 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  30.86 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 394 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  26.42 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 383 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  28.57 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.18 
 
 		 411 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  31.79 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  27.44 
 
 		 375 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  26.46 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  26.55 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>