284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3451 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
316 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  30.17 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 
344 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  29.43 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.64 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  31.73 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  38.46 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0003  anti-FecI sigma factor, FecR  30.81 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  33.79 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 
341 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.33 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  24.76 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  28.51 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  28.69 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  25.75 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  34.97 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  38.4 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  41.12 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  38.52 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.8 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  36.89 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  36.99 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  30.83 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  41.41 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  40.57 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  42 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.22 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  40.95 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  32.28 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  32.6 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  41 
 
 
389 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.49 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  37.6 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  35.45 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  40.38 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  34.31 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  27.65 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  27.05 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  36.94 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  28.44 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  26.24 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  33.62 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  34.86 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  29.75 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  31.62 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  28.87 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  29.27 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  38.38 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  42.42 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  46.51 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  35.65 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  39.09 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.34 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  39.67 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  39.42 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  45.79 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  36.72 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  41.67 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  36.94 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  38.38 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  36.19 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  25.86 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  25.68 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  40.59 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  45.65 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  43.68 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  24.57 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  38.78 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  39.64 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  40.66 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  27.49 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  38.32 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  27.32 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  34.55 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  27.14 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  42.86 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  37.8 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  34.53 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>