297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2763 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 381 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  33.42 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  35.03 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  34.55 
 
 		 381 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  32.64 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  32.4 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  35.84 
 
 		 342 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  34.46 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  30.47 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  29.32 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  30.31 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  28.28 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  27.96 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  32.22 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  26.49 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  30.73 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  26.69 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.64 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  27.93 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 324 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  28.26 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  27.02 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 278 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 		 329 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  28.76 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  25.09 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.59 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  35.47 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  26.72 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  26.01 
 
 		 315 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  33.57 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  25.45 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  29.07 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  27.54 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.38 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  29.22 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  29.38 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  31.49 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  28.07 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  31.61 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  31.75 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  28.31 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  25.68 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  30 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  26.96 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  24.71 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  29.07 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.05 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  34.3 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  29.95 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  31.11 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  29.38 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  38.19 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  27.98 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  24.34 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  26.58 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  27.83 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  31.61 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  41.84 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  32.95 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  26.01 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>