More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1846 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 360 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  32.61 
 
 		 376 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  35.18 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  31.84 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  34.17 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  30.4 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  33.42 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  38.1 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  37.08 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  30.92 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  29.83 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4694  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.446501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  30.35 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1414  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0503225  normal  0.125671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  29.56 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  30.51 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  28.42 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  35.19 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1703  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  30.61 
 
 		 345 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  29.26 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  27.42 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  32.39 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.45 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  31.11 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  35.03 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7044  anti-FecI sigma factor, FecR  31.1 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  25.74 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  29 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.9 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  32.93 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  24.93 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  27.09 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  24.69 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  26.28 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  24.52 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  25.16 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  27.03 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  33.03 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2819  anti-FecI sigma factor, FecR  31.2 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2444  anti-FecI sigma factor, FecR  37.12 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  26.17 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  26.89 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  32 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  30.61 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6661  anti-FecI sigma factor, FecR  26.64 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  29.02 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  26.22 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  39.32 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  33.13 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0442  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0522826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  30.81 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  25.83 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  32.54 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  34.4 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  24.54 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  26.51 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  26.84 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  27.4 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0149  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  25.99 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  32.53 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  26.77 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  27.62 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  28 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  28.17 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>