53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1878 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  84.06 
 
 
453 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  84.54 
 
 
453 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
446 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  83.09 
 
 
453 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  84.06 
 
 
453 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  83.82 
 
 
453 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  84.06 
 
 
453 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  68.03 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  68.03 
 
 
454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  68.03 
 
 
448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  68.03 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  67.87 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  68.03 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  68.03 
 
 
448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  68.03 
 
 
448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  54.46 
 
 
484 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  51.43 
 
 
484 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  33.88 
 
 
556 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  34.11 
 
 
568 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  32.44 
 
 
559 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  34.94 
 
 
558 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 
559 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 
394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  33.99 
 
 
591 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  30.4 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  31.91 
 
 
566 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  26.52 
 
 
543 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  29.24 
 
 
463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 
554 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  31.65 
 
 
335 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  31.16 
 
 
333 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  29.41 
 
 
664 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  31.15 
 
 
231 aa  57.4  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  29.17 
 
 
290 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  26.38 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 
1381 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  30.81 
 
 
1334 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.81 
 
 
586 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
380 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  25.18 
 
 
717 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  29.84 
 
 
155 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.35 
 
 
954 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  36.9 
 
 
3121 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  34.34 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  34.34 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  27.56 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  28.95 
 
 
153 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1985  hypothetical protein  22.6 
 
 
924 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  27.96 
 
 
213 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  32.97 
 
 
143 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  34.35 
 
 
327 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  26.45 
 
 
322 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>