58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4942 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 558 aa  1079    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  53.56 
 
 		 556 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  44.17 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  43.56 
 
 		 559 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  43.77 
 
 		 568 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  31.59 
 
 		 566 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  30.65 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  35.33 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  34.25 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  29.81 
 
 		 543 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  33.75 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  33.5 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  33.5 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  31.05 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  30.48 
 
 		 454 aa  163  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 448 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 448 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 448 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.21 
 
 		 591 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  30.18 
 
 		 454 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  30.37 
 
 		 484 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.21 
 
 		 484 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.31 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  29.84 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  28.52 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  28.41 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.02 
 
 		 954 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1159 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1159 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  31.18 
 
 		 837 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 318 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1157 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  30.22 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  35.9 
 
 		 338 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  30.71 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 250 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.08 
 
 		 1120 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  27.59 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  38.98 
 
 		 307 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  38.98 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 3333 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  43.48 
 
 		 288 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  43.48 
 
 		 288 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 327 aa  44.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  31.19 
 
 		 333 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  35.9 
 
 		 335 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  39.66 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  24.56 
 
 		 664 aa  43.9  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  33.68 
 
 		 868 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1158 aa  43.9  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1158 aa  43.9  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1460  fibronectin, type III  32 
 
 		 429 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>