72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5385 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 251 aa  516  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  47.18 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  49.34 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  49.11 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  47.23 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  45.98 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  41.21 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  35.64 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  34.13 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  35.64 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  34.63 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  27.31 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.31 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  29.95 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  26.87 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  31.66 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  33.08 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  28.92 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  28.84 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  23.16 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  28.65 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25.6 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  29.76 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  28.87 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  30.83 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  25.24 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  35.25 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  31.45 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  22.51 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  28.81 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.95 
 
 		 954 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 591 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  26.75 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 543 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  50 
 
 		 456 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  49.02 
 
 		 663 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  25.32 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  44.9 
 
 		 659 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  43.75 
 
 		 657 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  34.15 
 
 		 146 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  41.18 
 
 		 160 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  45.83 
 
 		 6272 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  33.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  44.23 
 
 		 96 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 5189 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 5236 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  34.12 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  31.91 
 
 		 384 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  41.51 
 
 		 96 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 389 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 161 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 161 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 559 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  41.51 
 
 		 1082 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 291 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  46.15 
 
 		 394 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.45 
 
 		 233 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>