21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1627 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  34.88 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  30.59 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.33 
 
 		 285 aa  64.7  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  26.95 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  26.97 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  24.84 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  24.18 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  25.38 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.49 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  27.97 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  26.57 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  24.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  23.78 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  29.84 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25.18 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  22.36 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  23.81 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  38 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>