32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2463 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  36 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  35.14 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  33.99 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  32.88 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  34.56 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  36.12 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  35.11 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  34.7 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  33.18 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.92 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  91.7  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.7 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  26.41 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  25.6 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  25.6 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  28.71 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  25.96 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  25.26 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.87 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  26.07 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  27.34 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  25.87 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  36.96 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  27.14 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>