48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2818 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  96.44 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  39.02 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  37.27 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  41.2 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  38.01 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  37.44 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.46 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  35.56 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  34.13 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  34.44 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  32.23 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  31.65 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  34.15 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  29.39 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.24 
 
 		 285 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  28.02 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  28.24 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  28.77 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  27.35 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  25.62 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  26.32 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  28.92 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  24.03 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  24.04 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  23.66 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  24.46 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  33.64 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  23.51 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.49 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  36.59 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  24.18 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  29.27 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 5236 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 5189 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  35.37 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  27.46 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  46.94 
 
 		 6272 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.83 
 
 		 954 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  23.87 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 546 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>