34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0370 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  50.72 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  47.14 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  39.01 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  40.91 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  38.35 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  39.59 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  38.46 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  33.99 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  35.29 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  35.82 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  33.5 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.2 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.95 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  28.23 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  25.36 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  28.5 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  28.77 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  29.33 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  35.25 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  27.75 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  28.23 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  26.09 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  22.07 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  22.5 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.95 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  25.38 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  26.83 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  26.35 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  29.87 
 
 		 146 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  25.81 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>