28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0233 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  36.11 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  28.92 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  28.92 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  26.71 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.22 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  26.97 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  31.39 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  25.47 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  29.1 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.79 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  28.38 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  24.5 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  26.25 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  23.19 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  23.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  29.37 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  28.76 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  43.48 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  25.81 
 
 		 225 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  39.13 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  21.98 
 
 		 239 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  21.3 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>