38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4346 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  40.67 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.39 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  37.16 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  36.16 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  31.65 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  30.92 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  95.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  31.3 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  30.95 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  29.06 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  29.46 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  30.84 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  33.18 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  23.87 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  29.21 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  30.66 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  31.21 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  27.8 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  32.95 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  28.65 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.03 
 
 		 285 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  27.36 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  21.95 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  24.15 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3820  hypothetical protein  28.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1884  hypothetical protein  28.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.27287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0936  hypothetical protein  28.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00416264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  26.06 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>