59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4389 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  48.25 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  47.23 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  41.2 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.37 
 
 		 285 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  43.07 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  38.43 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  37.21 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  36.29 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  35.56 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.66 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.36 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  28.43 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  26.29 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  29.55 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  30.29 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  22.9 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  29.28 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  28.23 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  26.63 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  25.29 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  28.38 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  25.86 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  24.87 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  25.42 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  26.07 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  26.15 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  24.41 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 		 97 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  44.9 
 
 		 659 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  43.75 
 
 		 657 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 591 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  45.1 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  23.5 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  37.14 
 
 		 543 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.11 
 
 		 954 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  27.88 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  28.06 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  46 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  44 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  44 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  44 
 
 		 156 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1315  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 377 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 145 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 145 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  28.4 
 
 		 318 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  45.83 
 
 		 663 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>