47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3821 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  38.73 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  37.62 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  41.21 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  36.89 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.27 
 
 		 285 aa  128  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  29.39 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  29.07 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  30.48 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.5 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  24.51 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  27.86 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  26.42 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  25.89 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  27.36 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  26.26 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  28.98 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  27.5 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  28.93 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  30.06 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  25.25 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  30.95 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  30.16 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.1 
 
 		 954 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  26 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  32.77 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  23.98 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 309 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  47.92 
 
 		 456 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  27.54 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  25.66 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  26.83 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  25.34 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  33.72 
 
 		 436 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  46.81 
 
 		 663 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 591 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  42.55 
 
 		 659 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 		 235 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 5236 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 5189 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>