17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0051 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 436 aa  899    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  35.96 
 
 		 202 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  37.66 
 
 		 546 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  39.62 
 
 		 235 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.57 
 
 		 954 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  33.72 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  39.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 		 242 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>