60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  62.33 
 
 		 219 aa  297  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  39.02 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  39.02 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  37.44 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  38.43 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  37.69 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  34.48 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  31.05 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.04 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.2 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  31.3 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  28.5 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  25.5 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  27.61 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  25.73 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  26.97 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  24.26 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  55.32 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  27.4 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  25.57 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  20.92 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  26.86 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  22.07 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  22.64 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  25.98 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  23.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  25.83 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 		 1910 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  38.57 
 
 		 96 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  28.24 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  38.57 
 
 		 96 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.67 
 
 		 954 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  26.5 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  43.75 
 
 		 568 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 559 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.31 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  29.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  29.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  44.68 
 
 		 456 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  29.13 
 
 		 377 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  35.59 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2538  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.828512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 234 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  40 
 
 		 663 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  33.85 
 
 		 474 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  23.29 
 
 		 194 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  29.63 
 
 		 160 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>