More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4237 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 1910 aa  3603    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  44.54 
 
 		 831 aa  176  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.55 
 
 		 318 aa  172  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  43.55 
 
 		 489 aa  166  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  43.89 
 
 		 789 aa  164  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.7 
 
 		 321 aa  155  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  44.89 
 
 		 557 aa  152  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  44.5 
 
 		 684 aa  152  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.44 
 
 		 1493 aa  149  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.75 
 
 		 961 aa  149  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.23 
 
 		 393 aa  148  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1402 aa  147  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  47.03 
 
 		 232 aa  146  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 		 359 aa  146  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  44.34 
 
 		 425 aa  141  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 		 1032 aa  141  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.6 
 
 		 255 aa  141  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.67 
 
 		 305 aa  140  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.73 
 
 		 346 aa  139  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.41 
 
 		 416 aa  139  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.79 
 
 		 267 aa  137  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.9 
 
 		 685 aa  137  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.57 
 
 		 448 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  42.92 
 
 		 256 aa  135  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  41.26 
 
 		 1877 aa  135  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.33 
 
 		 528 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.07 
 
 		 1012 aa  133  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.74 
 
 		 2413 aa  132  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.34 
 
 		 341 aa  132  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 		 343 aa  132  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 303 aa  130  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.6 
 
 		 271 aa  130  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1037 aa  129  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  43.17 
 
 		 1059 aa  128  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.81 
 
 		 380 aa  127  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36.32 
 
 		 552 aa  125  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.43 
 
 		 490 aa  125  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.43 
 
 		 490 aa  124  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33 
 
 		 376 aa  123  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.66 
 
 		 376 aa  122  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.69 
 
 		 1430 aa  122  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  40.41 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.2 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  44.17 
 
 		 1086 aa  121  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.91 
 
 		 976 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.32 
 
 		 235 aa  119  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.39 
 
 		 316 aa  119  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  44.3 
 
 		 185 aa  119  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  118  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  42.02 
 
 		 252 aa  118  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.28 
 
 		 1261 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 1110 aa  117  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  40.46 
 
 		 1134 aa  117  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.85 
 
 		 255 aa  117  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  39.88 
 
 		 1105 aa  116  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.09 
 
 		 380 aa  116  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  38.38 
 
 		 241 aa  115  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  43.09 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.77 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  42.29 
 
 		 1160 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.51 
 
 		 373 aa  113  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 1196 aa  113  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.49 
 
 		 464 aa  110  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.1 
 
 		 342 aa  110  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  43.75 
 
 		 246 aa  110  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.58 
 
 		 325 aa  109  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.58 
 
 		 325 aa  109  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.37 
 
 		 509 aa  108  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.57 
 
 		 380 aa  108  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.38 
 
 		 1002 aa  107  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  44.9 
 
 		 365 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 223 aa  107  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 523 aa  107  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  37.71 
 
 		 978 aa  107  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.02 
 
 		 838 aa  107  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  34.83 
 
 		 228 aa  106  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.37 
 
 		 509 aa  107  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.37 
 
 		 509 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  40 
 
 		 1105 aa  106  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  38.07 
 
 		 285 aa  106  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.78 
 
 		 329 aa  106  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.08 
 
 		 731 aa  105  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.74 
 
 		 267 aa  105  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.37 
 
 		 509 aa  105  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.96 
 
 		 331 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  42.01 
 
 		 315 aa  105  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.3 
 
 		 208 aa  104  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  38.64 
 
 		 763 aa  103  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  38.58 
 
 		 325 aa  103  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  37.95 
 
 		 482 aa  102  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.56 
 
 		 327 aa  102  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  36.57 
 
 		 357 aa  102  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.59 
 
 		 222 aa  102  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1281 aa  102  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  39.36 
 
 		 1242 aa  102  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.18 
 
 		 282 aa  101  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  36.5 
 
 		 1081 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  35.89 
 
 		 348 aa  100  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.28 
 
 		 272 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.26 
 
 		 1263 aa  101  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>