28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0937 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  91.67 
 
 		 96 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 591 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0855  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  38.57 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1136  hypothetical protein  38.14 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0823  hypothetical protein  46.81 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  52.08 
 
 		 334 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  37.74 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 251 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1750  hypothetical protein  39.24 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  34.38 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  37.04 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  43.14 
 
 		 568 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2557  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000246447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 1910 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1495  hypothetical protein  52.78 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.640402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1816  hypothetical protein  45.1 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.319712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>