51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2944 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  48.25 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  45.98 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  43.69 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  42.72 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.91 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  36.89 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  37.69 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  33.61 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  34.44 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.63 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  31.51 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  32.58 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  35.66 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  28.3 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  29.56 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  36.11 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  30.35 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  28.02 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  29.33 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  25.6 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  25.6 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  26.37 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  28.71 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  26.07 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  24.15 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  25.96 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  43.66 
 
 		 389 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  29.23 
 
 		 377 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.76 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  47.17 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  50 
 
 		 456 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  49.09 
 
 		 663 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 591 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 543 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  31.11 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.68 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  31.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  46 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  45.83 
 
 		 659 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  35.59 
 
 		 556 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  26.26 
 
 		 247 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>